がんの文献探しを簡略化したい
がんは世界的な死因の1つである。がん細胞を正常細胞と区別できる特徴は「HoC(the hallmarks of cancer)」と呼ばれ、HoCが腫瘍の解明に有用だと考えられている。
がんの研究成果の多くは、有名な生物医学文献データベース「PubMed」に掲載されている。研究者は欲しい文献をPubMedから収集できるが、がんは複雑で、多数のキーワード・同義語の組み合わせが必要となるため時間がかかってしまう。しかも、ラベル付けされた文献は非常に数が限られている。
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韓国にある忠北大学校のErdenebileg Batbaatarらは、トピックモデルを用いてHoCを分析するマルチタスクトピック解析(MTTA)のフレームワークを提案した。これによりラベル付けされていない文献を分析し、がんの特徴(HoC)のトピックの解析を試みた。
結果、がん文献のトピック抽出には成功しただろうか?続きを読んでみよう。
がんの特徴のトピックを可視化
Erdenebileg Batbaatarらの研究におけるミッション・手法・結果は以下の通りだ。
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